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所有探討白色恐怖的書籍與影像，大都以漢人為主體，而在噤若寒蟬的時代中，原住民族同樣亦步亦趨，深怕一個不對，就會遭遇清算，甚至危害家族。本片透過林瑞昌、林昭明與高一生故事，訴說台灣原住民族所受到的白色恐怖。

有一位泰雅族青年，達利亞那 ‧ 伊洛，決定在自己的臉上文面，他唯一的理由是，想要傳承和保存泰雅族的文化。要有多少勇氣，才能把泰雅的圖騰文在臉上？而八十多歲的文面耆老，拉娃，卻心疼的說達利真可憐啊。

《當部落遇到國家》整起事件的起伏轉折，正是千百年來，台灣原住民族在國家體制下受到壓迫的呈現。這是來自部落的純粹力量，因為司馬庫斯櫸木事件沒有宗教或政治背後的操作，只有族人集體的單純理念向國家扺抗。

花蓮 Makutaay 部落的年輕人要升級到青年組最高級－ Mama Nu Kapah 的升級儀式裡，在通宵歌舞之後，還要通過一口氣將一大碗米酒喝完的考驗。但是，隨著時代的轉變，現在的年輕人希望將傳統喝米酒的儀式改良，甚至廢除。他們的建議能不能得到部落長老的同意呢？

在民國四、五十年剛開放登山的年代，東埔的布農人伍勝美和全桂林是當時最優秀的高山嚮導，于右任銅像就是由他們揹上玉山，但是嚮導工作侵害他們的健康，腿和膝蓋都不堪負荷 … 本片紀錄他們的生活及對登山生涯的回憶。